生產管理是對一個動態的流程的管理，動態的、變化的數據十分復雜，其數據采集十分困難，增加了MES系統信息集成的難度。特別對于流程性制造企業，生產流程復雜、數據來源多且分散，同時底層生產執行控制系統還處于封閉狀態，各系統信息采集方式、存儲格式等都存在很大差異，MES系統要實現這些不同格式與形態的信息的整理、對比、分析、集成、匯總，進行綜合處理，實現異構網絡、異構系統和異構數據庫的數據綜合集成是MES信息集成的最大難點

首先，詳細生產計劃制定與生產排程是制造業企業對MES系統的重點應用之一，要實現這一應用，系統就必須實現對生產運行數據、工藝流程詳細、物料詳細、庫存信息設備狀態、人力資源等數據信息的集成和綜合處理，為生產計劃和生產集成提供信息依據，同時也為企業上層管理系統——ERP系統提供即時、準確的生產經營決策依據。

同時，信息集成是實現現代化生產管理的基礎，也是制造業企業實施MES系統的基礎。MES系統將生產執行控制系統中的生產動態信息、質量、物料利用信息、產品信息等進行實時整理、匯總，并能通過信息集成，實現生產調度、優化生產控制，同時也能將上層決策、指令傳遞至下層執行系統，實現全面的動態信息交互與生產全局掌控。